Penelitian tentang pemanfaatan media alami dipandu modul telah dilakukan di MAS Babun Najah Banda Aceh pada tanggal 15 Februari sampai 22 Februari 2016. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui peningkatan keterampilan proses sains, hasil belajar siswa serta hubungan keterampilan proses sains dengan hasil belajar melalui pemanfaatan media alami dipandu modul pada Submateri Invertebrata. Metode yang digunakan adalah metode pre-eksperimental dengan rancangan pretest posttest control design. Penelitian ini dilaksanakan pada satu kelas yaitu Xmia-3 dengan jumlah 31 siswa sebagai kelas eksperimen. Instrumen penelitian ini menggunakan tes keterampilan proses sains dan tes hasil belajar siswa. Analisis data untuk mengetahui peningkatan keterampilan proses sains dengan menggunakan uji paired t-test, untuk mengetahui peningkatan hasil belajar menggunakan uji paired t-test dengan bantuan SPSS 18.0 for windows, dan untuk mengetahui hubungan keterampilan proses sains dan hasil belajar menggunakan rumus korelasi. Hasil penelitian untuk keterampilan proses sains menunjukkan bahwa thitung -23,988 < 0.05, hasil uji t untuk hasil belajar siswa menunjukkan bahwa thitung -52,885 < 0.05 dan hubungan antara keterampilan proses sains dengan hasil belajar siswa menunjukkan nilai r =0.76. Disimpulkan bahwa terjadi peningkatan keterampilan proses sains dan hasil belajar siswa secara signifikan serta terdapat korelasi positif atau hubungan yang tinggi antara keterampilan proses sains dengan hasil belajar melalui pemanfaatan media alami dipandu modul pada Submateri Invertebrata di MAS Babun Najah Kota Banda Aceh. Kata Kunci: Media Alami, Modul, Keterampilan Proses Sains, Hasil Belajar, Invertebrata