Telah dilakukan penelitian mengenai Variasi Morfometrik dan Meristik Ikan Belanak (Mugil cephalus) di Estuaria Syiah Kuala Kota Banda Aceh dan Kuala Gigieng Aceh Besar, pada bulan Desember 2012-Mei 2013. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui variasi morfometrik dan meristik ikan belanak di Estuaria Syiah Kuala dan Kuala Gigieng. Metode sampling yang digunakan dalam penelitian ini adalah purpossive sampling. Sebanyak 17 karakter morfometrik dan 11 karakter meristik diamati pada penelitian ini, analisis 20 karakter nisbah morfometrik dan uji t dengan program SPSS. Berdasarkan pengamatan morfometrik dan meristik Mugil cephalus menunjukkan variasi. Terdapat perbedaan 12 karakter morfometrik dari 20 karakter nisbah yang dianalisis dan terdapat satu perbedaan meristik dari 11 karakter yanag diamati diantara Mugil cephalus di Estuaria Syiah Kuala dan Kuala Gigieng. Variasi antara populasi Mugil cephalus di Estuaria Syiah Kuala dan Kuala Gigieng karena letak georgafis yang berbeda dan respon terhadap lingkungan. Kata kunci: Mugil cephalus, morfometrik, meristik, Estuaria Syiah Kuala, Kuala Gigieng.