Terumbu karang merupakan habitat berbagai biota laut untuk tumbuh dan berkembang biak. Biota-biota yang berasosiasi dengan terumbu karang ada yang dapat menyebabkan kerusakan pada terumbu karang terutama avertebrata air invasif yang bersifat sebagai predator karang, sehingga memberikan dampak pada kerusakan struktur komunitas karang ataupun pada kelimpahan jenis karang. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui struktur komunitas avertebrata air invasif melalui pendekatan kelimpahan, keanekaragaman, keseragaman, dominansi, distribusi, dan perbandingan kelimpahan avertebrata air invasif dengan tutupan terumbu karang pada ekosistem terumbu karang di KKPD PISISI. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan September 2019 menggunakan metode purposive sampling untuk penentuan titik stasiun, sedangkan pengambilan data avertebrata air invasif menggunakan metode belt transect dan pengambilan data terumbu karang menggunakan metode Point Intercept Transect (PIT). Hasil penelitian ditemukan bahwa struktur komunitas avertebrata air invasif di KKPD PISISI tergolong dalam kategori baik yang ditunjukkan melalui nilai kelimpahan total avertebrata air invasif sebesar 39,67 ind/m2, indeks keanekaragaman avertebrata air invasif sebesar 1,50 dengan kategori sedang, indeks keseragaman sebesar 1,06 dengan kategori tinggi dan indeks dominansi sebesar 0,44 dengan kategori rendah. Distribusi avertebrata air invasif di KKPD PISISI tergolong ke dalam distribusi mengelompok. Perbandingan kelimpahan avertebrata air invasif tertinggi sebesar 12,83 ind/m2 dan persentase tutupan karang sebesar 29,83% serta kelimpahan avertebrata air invasif terendah 3,67 ind/m2 dan persentase tutupan karang sebesar 54,67% menunjukkan adanya pengaruh antara kelimpahan avertebrata air invasif terhadap persentase tutupan karang. Kata Kunci: Avertebrata Air Invasif, Distribusi, Struktur Komunitas, Terumbu Karang