Annonaceae merupakan salah satu tanaman penghasil metabolit sekunder yang beraneka ragam yang dapat berperan sebagai antimikroba.Ekstrak metanol bagian akar, kulit batang, daun dan bunga dari famili Annonaceae yaitu: Cananga odorata dan Polyalthia longifolia telah diuji dengan menggunakan metode Kirby Bauer. Ekstrak metanol dari tumbuhan yang diuji menunjukkan aktivitas antimikroba terhadap bakteri Staphylococcus aureus dan jamur Candida albicans.Ekstrak metanol kulit batang dan bunga dari tumbuhan Cananga odorata memiliki aktivitas terhadap bakteriStaphylococcus aureuspada konsentrasi 20% dengan diameter zona hambat masing-masing sebesar 6,05 ± 0,10 dan 6,30 ± 0,08 mm. Ekstrak metanol akar tumbuhanPolyalthia longifoliamemiliki aktivitas terhadap bakteri Staphylococcus aureus pada konsentrasi 1, 5, 10 dan 20% dengan diameter zona hambat masing-masing sebesar 10,52 ± 0,78; 15,04 ± 0,72; 15,52 ± 0,75 dan 16,3 ± 0,43 mm. Ekstrak metanol kulit batang tumbuhan Polyalthia longifoliamemiliki aktivitas terhadap bakteri Staphylococcus aureus pada konsentrasi 1, 5, 10 dan 20% dengan diameter zona hambat masing-masing sebesar 7,71 ± 0,72; 9,13 ± 0,88; 9,38 ± 0,43 dan 9,79 ± 0,41 mm. Ekstrak metanol daun tumbuhan Polyalthia longifoliamemiliki aktivitas terhadap bakteri Staphylococcus aureus pada konsentrasi 1, 5, 10 dan 20% dengan diameter zona hambat masing-masing sebesar 8,77 ± 0,31; 12,03 ± 0,40; 12,87 ± 0,54 dan 13,23 ± 0,76 mm. Ekstrak metanol kulit batang tumbuhan Polyalthia longifoliamemiliki aktivitas terhadap jamur Candida albicans pada konsentrasi 10 dan 20% dengan diameter zona hambat masing-masing sebesar 6,83 ± 0,27 dan 7,06 ± 0,03 mm. Bagian tumbuhan yang memiliki aktivitas antibakteri paling kuat adalah akar Polyalthia longifolia.