Pembuatan dan penerapan sistem E-Learning menggunakan ATutor, dimana ATutor merupakan aplikasi Open Source berbasis web yang didesain berdasarkan standarisasi Learning Content Management System (LCMS) dan didalamnya terdapat Sistem Operasi Windows, Web server, Database Server (MySQL), Web Viewer, dan Web Browser. dengan kemampuan yang baik dan adaptasi yang fleksibel untuk diintegrasikan dengan aplikasi lain. Dimana dapat membuat, mengatur suatu pembelajaran yang berkesinambungan secara online. Pengembangan E-Learning sangat diperlukan untuk menunjang pembelajaran yang konvensional, karena selama ini sistem pembelajaran online belum ada pada SMK Muhammadiyah. Dari hasil pembuatan E-Learning dengan menggunakan ATutor pada SMK Muhammadiyah, penulis mendaftarkan 3 mata pelajaran, I0 nama guru, dan 10 nama siswa, memodifikasikan fitur-fitur yang terdiri dari chat, forum, blog, group, tugas dan quis. Kata kunci : CMS, Database Server (My5QL), E-Learning