IDENTIFIKASI DAN KARAKTERISASI DNA MITOKONDRIA (mtDNA) PADA ORANGUTAN SUMATERA (Pongo abelii) DI TAMAN HEWAN PEMATANG SIANTAR (THPS) SUMATERA UTARA ABSTRAK Orangutan sumatera (Pongo abelii) merupakan salah satu satwa endemik Indonesia yang terancam punah. Konservasi sebagai salah satu cara untuk pelestarian satwa ini akan lebih terarah dan tepat guna apabila karakteristik dan keragaman genetiknya diketahui secara pasti. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi dan mengkarakterisasi gen Cytochrome b (Cyt b) DNA Mitokondria (mtDNA) pada Orangutan sumatera (Pongo abelii) di Taman Hewan Pematang Siantar (THPS) untuk mendapatkan informasi kekerabatan dan keragaman genetik. Sampel yang digunakan adalah feses dan urin yang berasal dari tiga ekor Orangutan sumatera yang dikoleksi secara non invasif dari Orangutan sumatera yang berada di Taman Hewan Pematang Siantar (THPS). Rancangan penelitian dilakukan identifikasi dan karakterisasi gen Cyt b melalui beberapa tahapan yaitu isolasi DNA menggunakan PureLinkR Genomic DNA Mini Kit dari Invitrogen,, amplifikasi DNA dengan metode Polimerase Chain Reaction (PCR), elektroforesis produk PCR, sekuensing dan analisis bioinformatika dan konstruksi pohon filogenetik menggunakan software MEGA 10.0. Gen Cyt b (585 pb) berhasil di amplifikasi pada semua sampel DNA. Berdasarkan hasil analisis keragaman genetik gen Cyt b menunjukkan bahwa ada keragaman genetik dari 3 ekor Orangutan sumatera yang berada di THPS, hal ini ditandai dengan adanya kluster terpisah pada filogram yang dianalisis dengan metode Neighbor joining tree dan dibandingkan dengan gen Cyt b pada Pongo pygmeus dan Homo sapiens. Kesimpulan berdasarkan Hasil analisis struktur pohon filogenetik menunjukkan bahwa ketiganya masih berada dalam kelompok Pongo abelii, namun isolat Cyt b2 berada pada kluster yang berbeda dari Cyt b1 dan Cyt b3, hal ini dipengaruhi oleh jarak genetik dari masing-masing isolat tersebut. Kata kunci : Pongo, Pongo abelii, Cytochrome b, mtDNA, sekuensing.