Salah satu metode analisis multivariat adalah MANOVA. MANOVA merupakan analisis yang digunakan untuk melihat perbedaan antar variabel secara simultan dari rata-rata beberapa variabel dependen berjenis metrik dan beberapa variabel independen berjenis kategorik. Penelitian ini bertujuan untuk melihat perbedaan nilai pengantar statistika berdasarkan jalur masuk dan jurusan dari mahasiswa. Data yang digunakan yaitu data nilai mata kuliah pengantar statistika tahun 2018, jalur masuk dan jurusan mahasiswa sarjana FMIPA Universitas Syiah Kuala angkatan 2017. Dari uji asumsi yang dilakukan, terdapat satu uji asumsi yang tidak terpenuhi, yaitu asumsi kesamaan matriks varians-kovarians. Karena uji asumsi ini tidak terpenuhi, maka uji signifikansi MANOVA yang dapat digunakan adalah uji signifikansi Pillai’s Trace. Hasil dari uji signifikansi MANOVA menunjukkan bahwa variabel nilai UTS, nilai UAS dan nilai Praktikum memiliki perbedaan terhadap jalur masuk dan jurusan, sehingga harus dilakukan uji lanjut yang bertujuan untuk melihat variabel apa saja yang memiliki perbedaan. Uji lanjut yang digunakan adalah uji lanjut Tukey dengan hasil yang didapatkan adalah nilai mahasiswa dengan jalur masuk UMB cenderung memiliki nilai UTS, UAS dan Praktikum lebih rendah dibandingkan nilai mahasiswa dengan jalur masuk SNMPTN dan SBMPTN. Sedangkan nilai mahasiswa dengan jalur masuk SNMPTN dan SBMPTN memiliki nilai UTS, UAS dan Praktikum yang bernilai sama. Nilai mahasiswa dengan Jurusan Biologi dan Kimia cenderung memiliki nilai UTS, nilai UAS dan nilai Praktikum lebih rendah dibandingkan dengan nilai mahasiswa jurusan lainnya. Dan mahasiswa Jurusan Statistika memiliki nilai UTS, UAS dan Praktikum paling tinggi di antara nilai mahasiswa jurusan lainnya. Nilai mahasiswa dengan jalur masuk SNMPTN dan Jurusan Statistika menjadi interaksi terbaik untuk nilai UTS dan UAS. Sedangkan untuk nilai Praktikum, interaksi terbaik adalah nilai mahasiswa dengan jalur masuk SBMPTN dan Jurusan Fisika.