Pada penelitian ini telah dirancang prototipe web service untuk aplikasi GNU Health dan KRS Online UNSYIAH, sebelumnya aplikasi GNU Health belum dilengkapi dengan kapabilitas web dan KRS Online UNSYIAH juga belum dapat membaca data kesehatan mahasiswa. Prototipe web service GNU Health yang telah dirancang didesain untuk menyediakan informasi dalam bentuk JSON bedasarkan data yang ada dalam basis data, sedangkan prototipe web service KRS Online UNSYIAH dirancang untuk membaca informasi JSON tersebut dengan memanfaatkan session data. Kedua prototipe ini dirancang dengan menggunakan framework CodeIgniter tetapi khusus untuk prototipe web service KRS Online UNSYIAH dilengkapi otentifikasi dari Tank Auth dan meniru template dari KRS Online UNSYIAH. Pengujian yang dilakukan untuk menguji fungsional dari kedua prototipe adalah pengujian dengan menggunakan aplikasi penjelajah Mozilla Firefox dan metode uji benar uji salah black box serta pengujian bedasarkan dua buah skenario. Bedasarkan hasil pengujian yang diperoleh, kedua prototipe ini telah berhasil dirancang sesuai dengan harapan dan melewati syarat-syarat yang telah ditentukan pada tahap analisa kebutuhan perancangan. Kata kunci: GNU Health, KRS Online UNSYIAH, Web Service, CodeIgniter, JSON