ABSTRAK Penelitian ini menggunakan DNA kloroplas, yaitu daerah matK, rbcL, dan trnHpsbA spacer sebagai DNA barcode. Tujuannya adalah untuk mengidentifikasi jenis pohon yang hidup di Hutan Rawa Gambut Tripa. Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Biologi Sel dan Molekuler FMIPA Universitas Syiah Kuala, Laboratorium Genetika Molekuler Institut Teknologi Bandung (ITB), dan Laboratorium Genetika Hutan dan Kehutanan Molekuler Institut Pertanian Bogor (IPB) dari Juni 2015 sampai Agustus 2016. Metode yang digunakan adalah eksperimental laboratorium. Data dianalisis menggunakan program BioEdit, Clustal X dan Mega 5.2.2. Hasil penelitian menunjukkan bahwa gen matK tidak dapat membedakan antar jenis pohon bahkan di tingkat Ordo, sedangkan daerah trnH-psbA specer sudah mampu membedakan sampai di tingkat Ordo dari tumbuhan Hutan Rawa Gambut Tripa. Gen rbcL sudah dapat membedakan jenis pohon hingga di tingkat Genus, sedangkan penggunaan multilocus dapat membedakan hingga di tingkat spesies dari tumbuhan Hutan Rawa Gambut Tripa. Kata kunci: hutan rawa gambut tripa, pohon, DNA kloroplas, gen matK, gen rbcL, dan daerah trnH-psbA specer