Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengisolasi bakteri Shigella sp dari sampel feses sapi yang berada di BPTU-HPT Indrapuri. Penelitian ini dilakukan dengan metode Cross-Sectional. Sampel feses diambil dari 85 ekor sapi, selanjutnya dilakukan isolasi bakteri Shigella sp menggunakan metode Carter. Isolasi Shigella sp dilakukan dengan menginokulasi feses sapi yang diambil menggunakan swab steril pada media Nutrient Broth (NB). Kemudian dilakukan penanaman pada media Eosin Methylene Blue Agar (EMBA). Dari 85 sampel 11 diantaranya diduga bakteri Shigella sp. Kemudian dilakukan perbanyakan bakteri pada media Nutrient Agar (NA). Selanjutnya dilakukan penanaman pada media Salmonella Shigella Agar (SSA) dan diinkubasikan pada suhu 37˚C selama 18-24 jam. Kemudian diambil 1 koloni yang terpisah untuk dilakukan perwarnaan Gram. Hasil penelitian menunjukkan tidak ada yang positif bakteri Shigella sp. Kesimpulannya tidak dapat diisolasi bakteri Shigella sp pada feses sapi aceh di BPTU-HPT Indrapuri.