Penelitian mengenai struktur mikroskopis dan distribusi karbohidrat mukus pada usus besar telah dilakukan pada musang pandan (Paradoxurus hermaphroditus). Penelitian ini dilakukan sejak bulan Juni hingga November 2013 di Laboratorium Mikroteknik FMIPA, Darussalam, Banda Aceh. Metode penelitian ini adalah eksploratif menggunakan tiga ekor musang pandan yang ditangkap secara purposive sampling. Struktur mikroskopis usus besar diamati dengan metode parafin menggunakan pewarnaan HE, sedangkan distribusi karbohidrat mukus dengan pewarnaan PAS. Data yang diperoleh dianalisis secara deskriptif dan ditampilkan dalam bentuk tabel dan gambar. Hasil penelitian menunjukkan usus besar musang pandan tidak memiliki lekukan asenden, tranversus, dan desenden. Dinding usus besar musang pandan terdiri atas lapisan mukosa, submukosa, tunika muskularis, dan serosa. Plika mukosa ditemukan pada setiap segmen usus besar dengan jumlah, tinggi, dan lebar yang bervariasi. Tunika muskularis pada kolon musang pandan tidak membentuk taenia coli. Distribusi karbohidrat mukus pada usus besar musang pandan terdapat pada sel goblet dan mikrovili epitel mukosa dengan intensitas warna merah magenta yang kuat. Kata kunci: musang pandan, usus besar, dan distribusi karbohidrat mukus