Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui jenis bakteri endofit pada akar tanaman kopi yang berpotensi sebagai agens antagonis. Penelitian ini dilaksanakan di Desa Sukaramai Atas dan Desa Sukaramai Bawah, Kecamatan Wihpesam, Kabupaten Bener Meriah, Provinsi Aceh dan di Laboratorium Ilmu Penyakit Tumbuhan, Program Studi Proteksi Tanaman, Fakultas Pertanian, Universitas Syiah Kuala, Darussalam Banda Aceh, dimulai sejak Bulan Juli 2015 sampai Januari 2016. Penelitian ini menggunakan metode deskriptif dan metode eksperimen. Rancangan percobaan yang digunakan pada uji antagonis adalah Rancangan Acak Lengkap (RAL) non faktorial, dengan 6 perlakuan, setiap perlakuan diulang sebanyak 4 kali. Peubah yang diamati meliputi karakteristik bakteri endofit hasil isolasi dari akar tanaman kopi secara makroskopis, dan persentase hambatan pertumbuhan koloni cendawan patogen Rigidoporus microporus. Terdapat 15 isolat bakteri hasil isolasi dari akar tanaman kopi dan terdapat 6 isolat bakteri endofit yang yang dikarakterisasi secara morfologi, yaitu isolat PS-S2(2) dan PS-S3(1) merupakan genus Bacillus sp.,S-SK2(2) merupakan genus Pseudomonas sp., PS-S2(1) dan PS-S3(2) merupakan genus Klebsiella sp., dan S-SK3(2) merupakan genus Xanthomonas sp. Kata Kunci: Akar kopi, Bakteri endofit, Patogen.