Pada sistem pembangkit listrik tenaga surya (PLTS) sistem mandiri menggunakan baterai untuk penyimpanan listrik dan digunakan pada malam hari. Untuk mengatur proses tersebut dibutuhkan charge and discharge controller. Pada penelitian ini dirancang sebuah charge and discharge controller berbasis mikrokontroler Atmega 328. Rancangan ini menggunakan DC chopper yang dikendalikan oleh mikrokontroler untuk mengatur tegangan panel surya menjadi tegangan yang sesuai spesifikasi baterai. Pengendalian tegangan otomatis dengan cara mengubah-ubah duty cycle PWM pada DC chopper berdasarkan tegangan dari panel surya. Baterai yang digunakan adalah lead acid jenis gel 12 V berkapasitas 4,5 Ah dengan sumber daya dari panel surya berdaya 50 Wp. Hasil pengujian pengisian terhadap baterai berkapasitas 25% dari pukul 10.00 sampai pukul 17.00 menunjukkan prototipe ini dapat berkerja mengatur tegangan masukan sebesar berkisar 14 V -14,8 V dan menghentikan pengisian pada tegangan 14 V atau tegangan maksimal pengisian baterai. Pengujian pembebanan dengan beban lampu DC 12 V 3 W dilakukan dari pukul 20.00 malam sampai pukul 06.00 pagi yang memperlihatkan pembebanan berhenti pada batas tegangan minimal atau 11.5 V. Kata kunci : baterai, PLTS, charge and discharge controller, Atmega 328 (Arduino Uno), DC chopper, duty cycle, PWM