Latar Belakang: Sepsis Neonatorum merupakan salah satu dari tiga penyebab utama kematian neonatal, terutama di negara berkembang seperti Indonesia. Risiko sepsis neonatorum multifaktorial dan salah satunya adalah persalinan. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui perbandingan kejadian sepsis neonatorum antara persalinan pervaginam dengan persalinan seksio sesarea. Metode: Jenis penelitian yang digunakan adalah analitik komparatif (non-eksperimental) dengan desain case control. Penelitian dilakukan pada bulan Juli 2015 dengan menggunakan data rekam medik neonatus yang dilahirkan di RSUDZA periode tahun 2014. Pengambilan sampel menggunakan consecutive sampling pada kelompok kasus dan kelompok kontrol. Analisa data menggunakan uji Chi-Square dan Odd Ratio. Hasil: Selama penelitian berlangsung, didapatkan 90 sampel neonatus yang dibagi menjadi 45 sampel kelompok kasus dan 45 sampel kelompok kontrol. Berdasarkan analisa statistik didapatkan hasil yang bermakna dengan nilai p=0,020