ABSTRAK Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji struktur komunitas plankton di padang lamun Pulo Aceh, Kecamatan Pulo Aceh, Kabupaten Aceh Besar. Waktu penelitian dilaksanakan pada bulan Oktober 2014 – Januari 2015. Penentuan lokasi pengambilan sampel penelitian ditentukan dengan metode survey explorative. Pengambilan sampel dilakukan pada 3 stasiun yaitu di Gampong Lamteng (stasiun I), Gampong Ulee Paya (stasiun II) dan Gampong Gugop (stasiun III). Dari hasil penelitian ditemukan 10 kelas plankton yang terbagi atas 2 kelas dari zooplankton dan 8 kelas dari fitoplankton. Kelimpahan individu tertinggi terdapat di Lamteng dengan nilai rata-rata 21621,62 ind/L (Oktober) dan 274285,71 ind/L (Januari). Tingginya kelimpahan plankton di Lamteng diikuti dengan kepadatan lamun yang tinggi. Genus Pseudo-nitzschia sp merupakan genus tertinggi diseluruh stasiun pengamatan. Indeks similaritas plankton antar stasiun diatas 50 % dan tergolong dalam kategori tinggi. Indeks keanekaragaman berkisar antara 2,87-3,31, indeks keseragaman berkisar 0,90-0,95, dan indeks dominasi 0,04-0,07. Secara keseluruhan indeks keragaman, keseragaman dan dominansi menunjukkan nilai positif (baik) yang menandakan ketiga stasiun masih dalam kategori stabil (moderat). Kata kunci : Pulo aceh, fitoplankton, zooplankton, struktur komunitas.