Sepsis pada neonatus sampai saat ini merupakan masalah serius yang ada di setiap rumah sakit. Resistensi antibiotik terhadap bakteri juga menjadi masalah yang paling sulit ditangani. Selain meningkatkan waktu dan biaya perawatan, infeksi pada aliran darah juga meningkatkan angka morbiditas dan mortalitas pada neonatus. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan identifikasi dan melihat sensitifitas pada bakteri penyebab sepsis pada neonatus di ruang rawat intensif neonatus Rumah Sakit dr.Zainoel Abidin Banda Aceh. Pada penelitian ini, darah pasien yang diduga mengalami sepsis diambil dan diperiksa di Laboratorium Mikrobiologi Klinik RSUD dr.Zainoel Abidin mulai Januari 2012 sampai Februari 2013. Dari 38 sampel penelitian yang dikultur, didapatkan adanya pertumbuhan bakteri pada 6 sampel biakan darah. Hasil isolasi dan identifikasi bakteri dari darah diperoleh Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) sebanyak 2 isolat, Klebsiella pneumonia strain penghasil Extended Spectrum Betalactamase (ESBL) sebanyak 3 isolat, dan Enterobacter yang telah resisten terhadap Amoksilin klavulanat (AMC), Sefuroksim sodium (CXM), dan Tetrasilin (TE) sebanyak 1 isolat.