Tujuan penelitian ini adalah untuk menguji dan menganalisis pengaruh komisaris independen dan struktur kepemilikan keluarga terhadap kinerja perusahaan pada perusahaan manufaktur yang terdaftar di Bursa Efek Indonesia (BEI) periode pengamatan 2009-2011. Jenis penelitian yang digunakan dalam penelitian ini adalah pengujian hipotesis. Dengan menggunakan metode purposive sampling dan balanced panel data, ada 66 perusahaan yang memenuhi kriteria sebagai sampel penelitian. Jenis data yang digunakan adalah data sekunder yang diperoleh dari Pusat Referensi Pasar Modal di Bursa Efek Indonesia. Analisis regresi linear berganda digunakan untuk menguji hipotesis. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa komisaris independen yang diukur dengan proporsi komisaris independen tidak memiliki pengaruh terhadap kinerja perusahaan yang diukur menggunakan ROE (return on equity) dan secara keseluruhan struktur kepemilikan keluarga memiliki pengaruh terhadap kinerja perusahaan yang diukur dengan ROE. Kata Kunci: Kinerja Perusahaan, ROE, Komisaris Independen, dan Struktur Kepemilikan Keluarga.