Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis efek penerapan fraksi harga minimum Rp1 sejak 6 Januari 2014 pada efisiensi harga kapitalisasi rendah dan biaya eksekusi pada Bursa Efek Indonesia (BEI). Mikrostruktur pasar Bursa Efek Indonesia (BEI) didasarkan kepada sistem emerging market-order driven yang mana berbeda dari pasar-pasar berkembang. Kemudian, penelitian ini berkaitan dengan saham-saham berkapitalisasi rendah diperdagangkan pada harga Rp200 sampai dengan kurang dari Rp500, dimana saham-saham tersebut sebelumnya diperdagangkan pada fraksi harga Rp5. Saham-saham berkapitalisasi rendah pada umumnya diperdagangkan kurang efisien secara informasi dan sebagian besar tidak dilibatkan oleh kalangan analis investor. Sehingga, mispricing dapat saja muncul dalam perdagangan yang tidak likuid dan para trader akan terjatuh dalam efisiensi perdagangan yang secara informasi lemah. Dengan menggunakan Ordinary Least Square (OLS) dan Regresi Kuantil, kami menemukan fraksi harga minimum secara tidak signifikan mempengaruhi efisiensi harga kapitalisasi rendah dan secara parsial mempengaruhi biaya ekskeusi. Fraksi harga minimum secara signifikan mempengaruhi rata-rata biaya eksekusi, tetapi secara tidak signifikan mempengaruhi median biaya eksekusi. Kemudian, dengan menggunakan General Linear Model (GLM), kami menemukan perbedaan yang tidak signifikan tingkat efisiensi harga kapitalisasi rendah antara sebelum penerapan fraksi harga minimum dan sesudah penerapan fraksi harga minimum. Kami juga menemukan perbedaan yang signifikan tingkat biaya eksekusi antara sebelum penerapan fraksi harga minimum dan sesudah penerapan fraksi harga minimum. Penemuan ini berkontribusi dalam mengevalusasi keefektifan kebijakan fraksi harga minimum dan kualitas pasar dalam perdagangan saham kapitalisasi rendah.