|
| |
|
DIANA EKA PUTRI. AMPLIFIKASI GEN DNA POLIMERASE DARI BAKTERI TERMO-HALOFILIK PRIA LAOT SABANG (PLS) A. Banda Aceh : Fakultas MIPA Universitas Syiah Kuala, 2020 |
|
AbstrakTujuan dari penelitian ini adalah untuk mengamplifikasi gen dna pol i dari bakteri termo-halofilik pria laot sabang (pls) a dengan teknik gene walking. amplifikasi dilakukan dengan metode pcr menggunakan enam pasang primer, yaitu fp4-rp4, fp4-rp5, fpk-rpb, fp3-rp2, fp5-rp1 dan fp1-rp4. dari semua primer, hanya empat pasang primer yang menghasilkan amplikon, yaitu fp4-rp5, fpk-rpb, fp3-rp2 dan fp5-rp1 dengan suhu annealing masing-masing 67,5, 62,9, 60,5 dan 68,2°c. ukuran gen ketika diamplifikasi menggunakan fp4-rp5 dan fpk-rpb primer adalah 1216 bp (fragmen forward), sedangkan ketika menggunakan fp3-rp2, fp5-rp1 dan fpk-rpb primer adalah 1192 bp (fragmen reverse). fragmen gabungan menghasilkan gen berukuran 2408 bp, yang sekitar 300 bp lebih kecil dari gen dna pol i utuh. analisis homologi dari fragmen forward menunjukkan bahwa pls a memiliki kekerabatan terdekat dengan bacillus caldolyticus strain neb414 (kemiripan 99%). ketika fragmen reverse digunakan, pls a memiliki kekerabatan
Baca Juga : SKRINING ANTIBIOTIK DAN IDENTIFIKASI GEN 16S RRNA DARI BAKTERI TERMO-HALOFILIK ISOLAT PRIA LAOT SABANG (PLS) 76 (Amelya Yolanda, 2018) ,
Baca Juga : SKRINING DAN OPTIMASI PRODUKSI PROTEASE DARI MIKROORGANISME TERMOFILIK DAN HALOFILIK ISOLAT LOKAL PRIA LAOT SABANG (Atikah, 2014) , dekat dengan geobacillus thermoleovorans ccb_us3_uf5 (kemiripan 97%). ketika fragmen gabungan digunakan, pls a memiliki kekerabatan terdekat dengan bacillus caldolyticus strain neb414 (87% kesamaan). analisis pohon filogenetik menggunakan fragmen forward menunjukkan bahwa pls a memiliki kekerabatan terdekat dengan bacillus caldolyticus strain neb414. bila menggunakan fragmen reverse dan kombinasi kedua fragmen, pls a memiliki kekerabatan terdekat dengan bacillus caldolyticus strain xm. prediksi struktural menggunakan swiss model menunjukkan bahwa dna pol i yang diterjemahkan dari fragmen forward adalah bagian dari domain eksonuklease 5' ke 3' dan memiliki kesamaan struktural dengan thermus aquaticus. dna pol i yang diterjemahkan dari fragmen reverse adalah bagian dari domain polimerase dan memiliki kemiripan struktural dengan geobacillus stearothermophilus. amplifikasi lengkap gen utuh dna pol i masih diperlukan agar struktur protein dapat diterjemahkan Tulisan yang relevan KARAKTERISASI DAN IDENTIFIKASI ISOLAT BAKTERI TERMOHALOFILIK YANG DIISOLASI DARI SUMBER AIR PANAS PRIA LAOT SABANG (sharfina maulidayanti, 2014) ,AMPLIFIKASI GEN DNA POLIMERASE DARI BAKTERI TERMO-HALOFILIK PRIA LAOT SABANG (PLS) A (DIANA EKA PUTRI, 2020) , SKRINING DAN STUDIPERTUMBUHAN MIKROORGANISME TERMO-HALOFILIK ISOLAT PRIA LAOT SABANG PENGHASIL LIPASE (Nurul Hikmatul Ulwiyah, 2014) , |
|
|
|
Kembali ke halaman sebelumnya
Terkini
PROSPEK EKSPOR KOPI ARABIKA ORGANIK BERSERTIFIKAT DI KABUPATEN ACEH TENGAH |
ANALISIS KOMPARATIF TINGKAT PENDAPATAN USAHATANI PADI SAWAH IRIGASI DAN PADI SAWAH TADAH HUJAN BERDASARKAN STATUS PENGUASAAN LAHAN DI KECAMATAN KUTA COT GLIE KABUPATEN ACEH BESAR |
KAJIAN PEMASARAN DAN KEUNTUNGAN PETANI KACANG TANAH DI KECAMATAN DARUSSALAM KABUPATEN ACEH BESAR |
STUDI PENDAPATAN RUMAH TANGGA PERTANIAN DI DATARAN TINGGI (KASUS DESA URING KECAMATAN BUKIT KABUPATEN BENER MERIAH) |
ANALISIS PENDAPATAN USAHATANI TEMBAKAU DI KECAMATAN BANDAR BARU KABUPATEN PIDIE JAYA |